برای اینکه یک برنامه نویسی اختصاصی کاملا مطابق با درخواست ها و سلایق مشتریان طراحی گردد، باید به یک سری از نکات توجه داشته باشید. در گام نخست باید فرآیند نیاز سنجی انجام بشود تا سایت مطابق با درخواست مشتریان باشد.

• همواره این نکته را مدنظر داشته باشید که استفاده از سیستم مدیریت محتوا نمی تواند پاسخگوی تمام نیازهای مشتریان باشد. بنابراین تشخیص صحیح برای طراحی وب سایت اختصاصی بسیار حائز اهمیت است.
• مسئله مهم دیگری که در کدنویسی باید به آن توجه داشت، کنترل کیفیت است. کنترل کیفیت باید با در نظر گرفتن تمامی استانداردهای بین المللی انجام شود.
• لازم است که برنامه نویسی اختصاصی با توجه به کاربردش، دقیق، انعطاف پذیر باشد و با توجه به اصول سئو پیاده سازی شود تا برای بهینه سازی سایت مشکلی به وجود نیاید.
• بکارگیری گرافیک و قالب سایت اختصاصی باعث می شود که بازدید سایت بالا برود و کاربران مدت زمان بیشتری در سایت بمانند.

لازم به ذکر است که در نرم افزارهای تحت وب، مسئله امنیت به برنامه نویسی اختصاصی بستگی دارد و امنیت یک وب سایت موضوعی است که به هیچ وجه نباید از آن غافل شد.

برخی از ماژول ها و برنامه ها هستند که در برنامه وردپرس و جوملا قابل اجرا نیستند. به همین دلیل لازم است که این ماژول ها را به صورت اختصاصی و سفارشی در سیستم مدیریت محتوا اجرا کنید.